Desde 1990 la UCA forma parte del Consejo Nacional de Universidades (CNU), el cual integra las universidades públicas y las privadas de servicio público que reciben subsidio estatal.

La Constitución Política vigente establece que el Estado debe asignar un 6% del Presupuesto General de la República a las universidades que forman parte del CNU. En el caso de la UCA, el financiamiento obtenido por esta vía, actualmente permite cubrir un 50% de su presupuesto anual de funcionamiento. Este se complementa con el aporte arancelario de estudiantes que disponen de los recursos económicos para hacerlo y con otras fuentes de financiamiento como consultorías, proyectos y venta de servicios, entre otros.

La viabilidad del modelo de gestión ha permitido la apertura de nuevas carreras y programas de posgrado; la mo-dernización de la infraestructura, laboratorios y tecnología; la capacitación constante del equipo de profesores, en su mayoría con estudios de posgrado; el aumento de la matrícula; y un trabajo directo de sus facultades, institutos y centros mediante la docencia, la investigación y la proyección
social en más del 50% del territorio nacional.